为什么说化石为进化论提供了最直接的证据？
今天地球上的物种有千百万种，若包括地质历史上已灭绝的物种，那将达到亿万种以上。它们形状各异，大小悬殊，有的结构很简单，有的结构极复杂，它们不是由什么超自然的神创造的，而是从最简单的原核生物一步一步演化而来。生物的演化历程可以从化石中找到证据。
约35亿年前，地球上出现了最简单、最原始的原核细胞（由细胞膜、细胞壁和原生质组成的单细胞）生物——蓝细菌（又称蓝藻）。至25亿年前，地球地层中只发现了原核细胞生物化石。如果已发现的20亿年前地层中的真核生物（即细胞包含有细胞膜、细胞质、各种细胞器和细胞核）化石可靠，那么真核生物的出现时间应不晚于20亿年前。接着，由藻类演化而来的最原始的动物化石出现了。最早期的动物和植物区别并不大，如最早期的沟鞭藻，因体内有叶绿素，可进行光合作用，故被称为藻类；有的学者称它为沟鞭虫，因它可靠鞭毛运动，故名。
在往后的地层中，人们找到了蠕虫类化石，接下来找到了半索类或脊索类化石、属脊椎动物的鱼类化石（如中国寒武纪早期的昆明鱼化石）、两栖类化石和爬行类化石，最后找到了哺乳类（包括人类）化石及鸟类化石。在生物的每一个演化阶段都可以找到很多化石证据。所以说，化石为达尔文的进化论提供了过去生物演化独一无二的历史线索，它们聚集在一起便能够帮助科学家绘制出地质历史的“生命之树”。这样的生命之树尽管不够完整，但离开了化石，我们就无法了解过去和现在各式各样的生物是何时、如何一步步演变而来的，更无法知道谁是它们的祖先。
更为重要的是，化石还提供了了解生物演化的许多缺失环节的线索和证据，譬如带羽毛的恐龙化石、始祖鸟化石、三趾马化石、众多远古的人类化石，通过它们，我们似乎能够亲眼看到生物演化的神奇过程。因此，从达尔文提出进化论至今，化石便一直是支持这一学说最有力、也是最直接的证据。
